Nach der Verhaftung der Guillaumes und dem Bekanntwerden des Falles in der Öffentlichkeit lief nicht nur die Beweisaufnahme für ein Verfahren vor Gericht. Auch die politische Aufarbeitung erwies sich als zwingend notwendig. Mit der Aufklärung befassten sich neben dem Parlamentarischen Vertrauensmännergremium (heute: Parlamentarisches Kontrollgremium) auch die Kommission „Vorbeugender Geheimschutz“ zur Prüfung von Sicherheitsfragen im Zusammenhang mit dem Fall Guillaume sowie der 2. Untersuchungsausschuss des Deutschen Bundestages der 7. Wahlperiode.